Versuche es doch mal mit Dämmwolle oder Akustikschaumstoff. Kostet relativ wenig und hilft wohl (rechnerisch oder so, kann es jetzt nicht gut erklären, habe es nur mal bei Youtube gehört) gegen Scheppern in der „Box“. Ggf. mal recherchieren.
Außerdem gucke mal, ob der Lautsprecher irgendwo anschlägt, wenn er vibriert. So ein ähnliches Problem hatte schon mal jemand bei einem kompakten Tonuino, er konnte dann mit einem Spacer (mehr Platz zwischen Lautsprecher und Löchern im Gehäuse) den Klang erheblich verbessern.