Der derzeitige Standard ist die Dev 2.1 bzw 2.2
Diese findet man sowohl im Repository von Thorsten also auch hier. Da gibt es jeweils einen Branch für die unterschiedliche Hardware. Die Software muss darauf ja jeweils angepasst werden. Die Apps und sonstigen Tools zum vom TonUINO unabhängigen konfigurieren der Karten beziehen sich meistens auf diese Version.
In der Entwicklung ist die 3.1. Die wird vermutlich irgendwann Standard werden.
Und ansonsten gibt es viele Forks, von denen jedoch die wenigsten aktiv gepflegt werden. Aktiv gepflegt und für allen Hardware-Varianten angepasst sind mir bekannt nur die beiden in der FAQ verlinkten
Der Affenboxfork hat zum Beispiel auch eine Möglichkeit den Fortschritt für „virtuelle“ Ordner zu speichern. Hier erfolgt die Speicherung auf der RFID-Karte weil der Speicher im TonUINO begrenzt ist.