Dachte ich mir schon, da ja 2 unterschiedliche Potentiale am Nano anliegen.
Ursprung für meine Frage ist folgender Aufbau:
hier hat der Ersteller zusätzlich zum Flashen einen USBPort nach außen geführt. Der Akkus ist jedoch glücklicherweise schaltbar. Zum Flashen also spannungsfrei schalten.