Moin!
Du meinst hierbei vermutlich die nötigen Schritte, um den Upload mit der IDE machen zu können.
Veruch mal platformio für den Upload zu nutzen.
Hier ist eine Schritt für Schritt Anleitung dafür.
Dein Problem scheint ja der Bootloader zu sein. Das kannst du in platformio selbst beheben.
Das o.a. kannst du in platformio direkt ändern.