HEUREKA!
Habe letztendlich nochmal alle 63 Ordner über das Tool von Brento (TinoTool - Windows GUI zum SD Karte befüllen) auf die SD Karte geschrieben und nur die Nummern belassen. So ein tolles Tool hatte ich beim anlegen meiner Boxen leider noch nicht zur Hand, das geht ja schön einfach 
Bisher hatte ich immer nur mit dem Tool "Ant Renamer"Zahlen vor den Dateinamen die Nummerierung gesetzt.
Jetzt geht es wieder wie gewohnt.
Ich denke, das sich doch irgendwo Sonderzeichen, oder so versteckt hatten…Danke für eure Unterstützung